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新方法可無(wú)損破譯基因表觀(guān)遺傳密碼

熱門(mén)推薦: 破譯基因 脫氨酶 遺傳密碼
來(lái)源:科技日報
  2018-10-11
美國賓夕法尼亞大學(xué)研究人員開(kāi)發(fā)出一種破譯DNA表觀(guān)遺傳密碼的新方法,利用DNA脫氨酶進(jìn)行基因測序。他們8日在《自然·生物技術(shù)》雜志上發(fā)表論文稱(chēng),新測序方法克服了沿用數十年的亞硫酸氫鹽測序法的局限,將有助于更深入理解腫瘤生成等復雜生物過(guò)程。

       美國賓夕法尼亞大學(xué)研究人員開(kāi)發(fā)出一種破譯DNA表觀(guān)遺傳密碼的新方法,利用DNA脫氨酶進(jìn)行基因測序。他們8日在《自然·生物技術(shù)》雜志上發(fā)表論文稱(chēng),新測序方法克服了沿用數十年的亞硫酸氫鹽測序法的局限,將有助于更深入理解腫瘤生成等復雜生物過(guò)程。

       表觀(guān)遺傳指的是在基因核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因表達的可遺傳變化。對于表觀(guān)遺傳密碼的分析,有助于更好地理解和診斷包括癌癥在內的一系列疾病,因而成為醫學(xué)研究的一個(gè)重要方向。

       在過(guò)去幾十年里,用來(lái)破譯表觀(guān)遺傳密碼的主要方法依賴(lài)于一種叫做亞硫酸氫鹽的化學(xué)物質(zhì)。但以此種物質(zhì)為基礎的測序方法雖然有用,卻也有不少局限,其中最重要一點(diǎn)是,亞硫酸氫鹽會(huì )破壞它接觸到的大部分DNA,經(jīng)其修飾后能夠留下的測序材料會(huì )很少。

       此次,賓夕法尼亞大學(xué)開(kāi)發(fā)的新方法則有效克服了上述局限。研究人員引入了一種被稱(chēng)為載脂蛋白信使RNA編輯酶催化多肽(APOBEC)的脫氨酶,這種DNA脫氨酶可以有效區分胞嘧啶修飾狀態(tài),其所能達到的效果與使用亞硫酸氫鹽相似,但不會(huì )損傷DNA。

       研究表明,使用新方法測定一種神經(jīng)元的表觀(guān)遺傳密碼,所需的DNA輸入要比使用亞硫酸氫鹽測序法少很多,只有后者的千分之一。過(guò)去有些表觀(guān)基因組研究由于樣本稀缺很難開(kāi)展,測序所需DNA輸入大幅降低,意味著(zhù)測序適用范圍的擴大,將有助于推動(dòng)這類(lèi)研究。

       研究人員表示,新方法克服了以亞硫酸氫鹽為基礎的測序方法的許多局限,擴大了表觀(guān)基因組分析的范圍,提供了研究表觀(guān)遺傳密碼的新手段,這對于更深入理解神經(jīng)系統發(fā)展、腫瘤生成等復雜的生物過(guò)程具有重要意義。

       

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