檢測腫瘤釋放進(jìn)入血液中的游離DNA（cfDNA，cell-free DNA）的突變是一種極具潛力的癌癥檢測方法。然而這類(lèi)檢測的敏感性和準確性及其檢測早期癌癥的能力目前仍然處于低水平【1-4】。一種潛在的替代方法是檢測cfDNA上的甲基化水平，因為在腫瘤中，DNA甲基化水平會(huì )發(fā)生顯著(zhù)的變化。
早期的全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing，BS-Seq)盡管有在cfDNA上測試過(guò)，然而由于在DNA在重亞硫酸鹽轉換（bisulfite conversion）過(guò)程中有將近84-96%會(huì )降解【5】，并且面臨成本高、信息覆蓋有限等問(wèn)題。因此，發(fā)展一種可以敏感檢測游離DNA甲基化并且能進(jìn)行高通量測序的技術(shù)顯得十分有意義。
11月15日，來(lái)自加拿大多倫多大學(xué)健康網(wǎng)絡(luò )（University Health Network）的研究人員在Nature發(fā)表了題為Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes的研究論文，描述了一種可以敏感檢測癌癥DNA甲基化的技術(shù)。雖然該技術(shù)還需要通過(guò)獨立樣本驗證該研究結果，但是這些發(fā)現有望改進(jìn)非侵入式癌癥檢測。
在這項研究中，Daniel De Carvalho及同事開(kāi)發(fā)了一種分離、檢測和描述低水平DNA甲基化的技術(shù)，即“游離DNA甲基化免疫共沉淀測序”（cell-free methylated DNA immunoprecipitation and high-throughput sequencing，cfMeDIP-seq）。該技術(shù)可以敏感地檢測低水平的DNA甲基化（DNA使用量可以低至100ng），而且與其它已有檢測手段相比仍不失準確性。
該研究稱(chēng)，該檢測技術(shù)能夠區分24名早期 胰 腺癌患者和健康對照組的cfDNA中的DNA甲基化。此外，對于388個(gè)來(lái)自7種不同腫瘤（急性髓性白血病、 胰 腺癌、結腸癌、乳腺癌、肺癌、腎癌和膀胱癌）和健康供體的樣本，該檢測技術(shù)能夠鑒定出可以區分不同癌癥的特定甲基化譜。
對于cfMeDIP-seq技術(shù)來(lái)說(shuō)，雖然還需要開(kāi)展進(jìn)一步的研究加以驗證，但是上述研究突顯了cfDNA甲基化譜用以準確檢測多種早期癌癥的潛力。
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