12月21日,頂級期刊Science評選出“2018年度十大科學(xué)突破”,其中7項成果與生物醫學(xué)領(lǐng)域相關(guān),而“追蹤單細胞發(fā)育譜系”(Development cell by cell)榮登年度突破之首。
這份榜單末尾,有一個(gè)特殊版塊——“負面事件”(BREAKDOWNS),上月?tīng)幾h得沸沸揚揚的“首例基因編輯嬰兒”事件因為道德、倫理?yè)鷳n(yōu)而被納入其中。
單個(gè)細胞的發(fā)育過(guò)程
一個(gè)受精卵究竟是如何產(chǎn)生構成完整身體的多種細胞類(lèi)型、組織和器官的?這是生物學(xué)領(lǐng)域的謎題之一。如今,結合單細胞測序技術(shù)和新型計算工具,來(lái)自哈佛大學(xué)、Broad研究所等機構的科學(xué)家們提供了關(guān)于這一過(guò)程最詳細的圖片。4月26日,Science雜志用3篇論文報道了這一突破性成果。
我們知道, DNA是協(xié)調細胞增殖、分化的基礎。所以,靶向單細胞內的基因(何時(shí)表達、誘導細胞分化),最終能夠拼湊出胚胎發(fā)育的細節。
具體而言,這一探究過(guò)程分成了“三部曲”:首先,研究團隊從生物體中分離出數千個(gè)完整的細胞;隨后,對每個(gè)細胞的遺傳物質(zhì)進(jìn)行有效的測序;最后,利用計算機或細胞標記工具,重建這些細胞的時(shí)間與空間關(guān)系。
得益于這一系列技術(shù),科學(xué)家們描繪出胚胎發(fā)育的驚人細節,以前所未有的清晰度,看清單個(gè)細胞的發(fā)育過(guò)程。他們已弄清楚扁蟲(chóng)、青蛙、斑馬魚(yú)等多種動(dòng)物的發(fā)育過(guò)程,證實(shí)斑馬魚(yú)最初的單細胞胚胎能夠產(chǎn)生25種主要的細胞類(lèi)型。
發(fā)育生物學(xué)家曾經(jīng)認為,一旦一個(gè)細胞開(kāi)始沿著(zhù)一個(gè)方向發(fā)展(如發(fā)育成一個(gè)肌肉細胞),那它就不會(huì )“偏離”這個(gè)方向。然而,這項新研究發(fā)現,一些斑馬魚(yú)細胞會(huì )在“半路”轉向另一個(gè)發(fā)展方向。
科學(xué)家們認為,這部“樂(lè )章”將改變未來(lái)10年的生物學(xué)研究。而單細胞革命才剛剛開(kāi)始。
首個(gè)基因沉默藥物獲批上市(Gene-silencing drug approved)
今年8月,FDA宣布批準第一款基于RNA干擾(RNAi)技術(shù)的治療藥物——patisiran,適用于一種損傷心臟、神經(jīng)功能的罕見(jiàn)病。
Patisiran由Alnylam公司研發(fā),通過(guò)沉默與罕見(jiàn)疾病——遺傳性轉甲狀腺素蛋白淀粉樣變性(hereditary transthyretin amyloidosis)有關(guān)的基因,阻止突變的轉甲狀腺素蛋白(TTR)在體內積累,進(jìn)而防止心臟和神經(jīng)功能受損。
1998年,科學(xué)家們首次在線(xiàn)蟲(chóng)體內證實(shí)RNA干擾沉默基因的成果。2002年,Alnylam成立。4年后,RNAi領(lǐng)域的兩位杰出科學(xué)家——斯坦福大學(xué)醫學(xué)院的Andrew Fire、馬薩諸塞大學(xué)醫學(xué)院的Craig Mello榮獲諾貝爾生理學(xué)或醫學(xué)獎。
這是自20年前RNAi技術(shù)(可以針對性沉默與疾病相關(guān)的特定基因,從而阻止致病蛋白的表達)被發(fā)現以來(lái),首個(gè)被證實(shí)有臨床價(jià)值并獲批上市的RNAi藥物。
分子“CT”(Molecular structures made simple)
2018年10月,兩個(gè)研究團隊同時(shí)發(fā)表論文,揭示了一種新的方法,可以在短短幾分鐘內確定小有機化合物的分子結構,打破了傳統方法要求的幾天、幾周或幾個(gè)月的“時(shí)間界限”。
他們向微小的3D晶體發(fā)射電子束,并跟蹤每次輕微旋轉時(shí)衍射圖案的變化情況,從而能夠在幾分鐘內生成3D晶體的分子結構。這項技術(shù)非常適用于繪制激素和潛在藥物的小分子結構。
學(xué)界評價(jià)說(shuō):這是小分子化學(xué)結構鑒定的顛覆性突破,對于未來(lái)藥物的研發(fā)、分子探針的設計以及疾病病理的解析都有著(zhù)重要意義。
古老的人類(lèi)“混血兒”(An archaic human ‘hybrid’)
今年,來(lái)自于德國馬克斯•普朗克人類(lèi)演化研究所的研究團隊發(fā)表了一項重要成果:他們發(fā)現了一塊非凡的古代混血遺骸——其父親是尼安德特人,母親是丹尼索瓦人。他們大約生活在90000年前,都是早已滅絕的人類(lèi)。
其中,尼安德特人主要居住在歐洲,丹尼索瓦人曾遍布亞洲。而這塊骨骼的擁有者被證實(shí)是丹尼索瓦人和尼安德特人的第一代混血后代。
一位遺傳學(xué)家評價(jià)道:“在諸多接受了基因組測序的人類(lèi)中,她可能是有史以來(lái)最令人著(zhù)迷的。”
法醫系譜學(xué)走向成熟(Forensic genealogy comes of age)
Joseph James DeAngelo是一名臭名昭著(zhù)的罪犯,在上世紀70年代和80年代共犯下12起謀殺案、45起強奸案和120起入室行竊案。但是,警察們卻無(wú)法確定嫌疑犯,因為這名兇手被稱(chēng)為暗夜尾隨者和“金州殺手”(Golden State Killer)。
為了捉到他,警察們求助了一項強大“武器”——通過(guò)遺傳系譜來(lái)識別罪犯。通過(guò)將犯罪現場(chǎng)的DNA檔案上傳到GED match(系譜學(xué)家共享的公共數據庫)上。隨后,他們找到了兇手的第三代或第四代表親,并建立了兇手的家譜,最終鎖定兇手。
借助于“法醫系譜學(xué)”,執法機構已經(jīng)成功解決了約20起之前難以破解的謎案。
雖然關(guān)于這一策略背后的侵犯隱私問(wèn)題一直存在爭議,但是“金州殺手”案件讓大家達成一致,至少系譜學(xué)可以用于鑒定暴力型罪犯。
原始世界的分子窗口(Molecular windows into primeval worlds)
今年9月,Science期刊發(fā)表了一篇文章揭示,在一塊距今6.35-5.41億年前 億年前生物化石(狄更遜水母,Dickinsonia)中發(fā)現了膽固醇分子,這是動(dòng)物生命的標志??茖W(xué)家們確認,這種生物是地球上已知最古老的動(dòng)物之一。
隨后的10月,另一研究團隊在來(lái)自6.6-6.35億年前的巖石中發(fā)現了一種僅由海綿構成的分子痕跡。這意味著(zhù),海綿這種形式的動(dòng)物生命形式,可能比已有最古老的化石早進(jìn)化了一億年。
細胞內的“相分離”(How cells marshal their contents)
細胞是構成生命體的基礎單位,其內的各組分是如何協(xié)調,以確保在正確的時(shí)間、地點(diǎn)行使生理功能的?科學(xué)家們發(fā)現,這與細胞內的液滴(Liquid droplet)有關(guān)。最新研究發(fā)現,液滴在細胞中無(wú)處不在。
從2009年開(kāi)始,科學(xué)家們就已發(fā)現,細胞內的許多蛋白質(zhì)能夠分離或濃縮成離散的液滴。
這種“液-液相分離”類(lèi)似于油和醋在醬汁中的“分離”是細胞生物學(xué)中最熱門(mén)的話(huà)題之一,因為有證據表明,這種分離促進(jìn)了關(guān)鍵的生化反應,似乎是細胞的基本組織原理。
今年,Science期刊上的3篇論文表明,這種“相分離”負責驅動(dòng)DNA轉錄為RNA。
負面事件:基因編輯嬰兒
值得一提的是,在前兩日Nature期刊推出的“2018年度十大人物”榜單中,因為“首例基因編輯嬰兒”事件在整個(gè)學(xué)界乃至全球掀起爭議的賀建奎名列其中。
Science認為,這是一個(gè)充滿(mǎn)倫理爭議的主張。
人類(lèi)重寫(xiě)自己的遺傳密碼是一項不小的成就。另一方面,在不同的環(huán)境下,種系基因編輯很有可能成為今年科學(xué)的突破。但是“編輯嬰兒”明顯打破了生物倫理的底線(xiàn)。
事件公開(kāi)后,賀建奎只在第二屆人類(lèi)基因組編輯國際峰會(huì )上露過(guò)一次面,至今毫無(wú)消息。
賀建奎用一種被稱(chēng)為CRISPR的基因編輯技術(shù)改變了嬰兒的基因組,目的是為了保護孩子不受HIV感染。但事實(shí)上,業(yè)界權威人士認為,賀建奎的試驗沒(méi)有任何意義,而且是不道德的、不應該做的。
學(xué)界認為,他的“冒進(jìn)”打破了關(guān)于生殖細胞試驗的共識,也違反了嚴重違反了中國相關(guān)法規、規定和指南(絕不應開(kāi)展和資助此類(lèi)研究)。
寫(xiě)在最后
這一評選是Science每年的傳統,他們會(huì )邀請記者、編輯和業(yè)界人士推選年度“突破”成就或科學(xué)發(fā)現,并讓廣大讀者進(jìn)行投票。所以,這一榜單也被認為是“the People's Choice—along with Science's choice”。
在今年的“投票環(huán)節中”,單細胞發(fā)育、基因沉默藥物分別以35%、30%的占比贏(yíng)得了第一、二名。2018年已接近尾聲,這些科學(xué)成就還只是一個(gè)個(gè)新的開(kāi)始,未來(lái),它們終將在生命醫學(xué)史上留下更多的印記……
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