地球上的所有生命的遺傳密碼都基于四種核苷酸。而現在,科學(xué)家已經(jīng)創(chuàng )造出了由八種核苷酸組成的雙鏈DNA。
根據今日發(fā)表于《科學(xué)》雜志的一篇文章,研究人員通過(guò)將四種合成核苷酸與天然存在于核酸中的四種核苷酸相結合,突破性地創(chuàng )造了具有“八字母”的DNA分子結構,名為“Hachimoji(日語(yǔ)‘八’和‘字母’) DNA”。這是科學(xué)家首次創(chuàng )造出一種合成的“八字母”遺傳語(yǔ)言,該分子結構和功能與天然的DNA分子相似,可以?xún)Υ嫘畔⑸踔帘晦D錄成RNA。研究人員表示,這種“八字母”DNA分子的信息存儲能力是天然核酸的兩倍,可能存在廣闊的生物技術(shù)應用前景。此外,這一結果也擴大了可能支持生命的分子結構范圍,包括整個(gè)宇宙的生命,表明了更廣泛的化學(xué)物質(zhì)可以支持生命。
在論文發(fā)表后,諸多業(yè)內資深人士也對這項成果表達了由衷的贊嘆。
“這真是一篇激動(dòng)人心的論文……一項杰出的技術(shù)成就。它如此優(yōu)雅地增加了DNA及RNA構建模塊的數量,并大大擴展了核酸的信息密度。”來(lái)自美國西北大學(xué)的生物工程學(xué)家Michael Jewett并未參與這項研究,但對這項成就贊嘆不已。
來(lái)自斯克里普斯研究所的Floyd Romesberg對此評價(jià)道:“Steve現在所展示的是,你可以將DNA的單位翻倍,并保持可預測的化學(xué)過(guò)程,我認為這是驚人的,這是一項里程碑式的成就。”他還補充道,這項研究表明,在地球上進(jìn)化出的四種化學(xué)物質(zhì)并沒(méi)有什么特別的“魔力”或特殊含義。 “這是一個(gè)概念上的突破。”
美國里士滿(mǎn)大學(xué)生物學(xué)家Eugene Wu也表示:“看到有人設計出這樣一個(gè)系統,真是令人興奮。它引人思考這樣一個(gè)生命起源的問(wèn)題:為什么這4個(gè)核苷酸形成了核酸?為什么不能是8或者其他數字呢?”
無(wú)論是什么原因,在過(guò)去的40億年左右,只有兩種堿基對,即A-T、C-G,或者在RNA情況下的A-U,是大自然創(chuàng )造地球上無(wú)窮無(wú)盡生命所需要的一切基礎。但論文通訊作者、佛羅里達州應用分子進(jìn)化基金會(huì )項目負責人Steven Benner則表示,理論還有更多可能。
當嘌呤(G或A)通過(guò)氫鍵與嘧啶(C、T或U)相連接時(shí),堿基對就形成了。然而,也有其他嘌呤和嘧啶型的結構可以假設連接產(chǎn)生與標準DNA相同的螺旋結構。長(cháng)期以來(lái),科學(xué)家一直試圖在遺傳密碼中添加更多對堿基。例如,在20世紀80年代,Steven Benner首次創(chuàng )造了“非自然”的堿基。其他研究小組也緊隨其后。Steven Benner預計總共有4種其他氫鍵堿基對是可能存在的,它們由8個(gè)新的結構組成。他認為:“從本質(zhì)上講,DNA還沒(méi)有完全利用其結構極限。正因為如此,DNA分子可以被擴展……你可以添加更多‘字母’。”
此前,Steven Benner研究團隊已經(jīng)將兩個(gè)合成核苷酸(Z-P堿基對)結合到DNA中,并證明它們可以在體外復制和轉錄?,F在,該團隊再次增加了一種堿基對——S和B。
作為信息存儲系統,DNA必須遵循可預測的規則。團隊首先證明,與常規堿基類(lèi)似,合成堿基能夠可靠地形成配對。他們創(chuàng )造了數百個(gè)合成DNA分子,發(fā)現這些字母可以被預測地聯(lián)系在一起。此外,研究團隊還表明,無(wú)論合成堿基的順序如何,雙螺旋結構都能夠保持穩定。該團隊將化學(xué)合成的新型核苷酸整合到雙鏈寡核苷酸(含有G、A、T、C、Z和P)中,然后測試了這些分子的熔解溫度,即氫鍵斷裂形成單鏈分子的溫度。研究人員觀(guān)察到熔解溫度平均在預測值的2.1℃以?xún)?,與標準DNA寡核苷酸的誤差范圍類(lèi)似,具可預測的熱力學(xué)穩定性。三種不同“Hachimoji DNA”寡核苷酸的高分辨率晶體結構也證實(shí)了結構的相似性。
從化學(xué)上講,“Hachimoji DNA”的外觀(guān)和表現與標準DNA相似。然而,能夠讀懂和處理核酸的酶是很難被欺騙的,因此,為了將“Hachimoji DNA”轉錄成RNA,研究團隊嘗試了許多噬菌體RNA聚合酶變體,直到團隊發(fā)現其中一種能夠完成這項任務(wù)。利用這種RNA聚合酶,研究團隊轉錄了一種已知的RNA適配體的“Hachimoji”版本。這種適配體名為“Spinach”,能夠結合并照亮一個(gè)特定的熒光團。不出所料,轉錄的“Hachimoji RNA”能夠如預期的那樣發(fā)光。
毫無(wú)疑問(wèn),產(chǎn)生功能性“Hachimoji RNA”的能力為RNA生物技術(shù)領(lǐng)域開(kāi)辟了許多可能性。RNA可以作為催化分子,所以使用新型核苷酸鏈,則可以產(chǎn)生更多官能團,它們可以與目標分子進(jìn)行不同類(lèi)型的相互作用,增加催化范圍。“Hachimoji DNA”甚至可以與其他基于不同堿基對的人工合成核苷酸相結合,從而進(jìn)一步提高功能。
對于這種剛剛問(wèn)世的新型分子結構,無(wú)數更廣闊的應用領(lǐng)域正在不遠的未來(lái)。更重要的是,“Hachimoji DNA”的存在突破了自然界遺傳語(yǔ)言的界限,或許在某個(gè)遙遠的外星世界,生命形式正以我們從未想象到的形式存在。
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