4月22日，PacBio SMRT測序技術(shù)高峰論壇在北京召開(kāi)，本次會(huì )議上PacBio官方首次發(fā)布了備受矚目的Sequel II測序平臺。配置了全新的8M SMRT Cell，Sequel II單張芯片通量較Sequel平臺提升了8倍左右，數據質(zhì)量方面也有明顯改善。安諾優(yōu)達作為全球首批Sequel II 用戶(hù)，見(jiàn)證了本次新平臺的發(fā)布，并于今年5月底前正式對外提供Sequel II測序服務(wù)。
Sequel II 平臺介紹
Sequel II平臺仍舊采用了PacBio公司經(jīng)典的SMRT 測序技術(shù)，將測序芯片SMRT cell進(jìn)行了全新升級，芯片上的零模波導孔（ZMW）的數量由100萬(wàn)升級到了800萬(wàn)，大大提升了單張芯片的測序通量。目前Sequel II平臺運行CLR (continuous long read)文庫，采用10h的運行時(shí)間，單張芯片平均產(chǎn)出高達75Gb；而運行Hifi文庫 (highly accurate long reads)，采用30h的運行時(shí)間，單張芯片平均產(chǎn)出高達250Gb，較前一代Sequel平臺有顯著(zhù)提升。
數據質(zhì)量
Sequel II平臺除測序通量進(jìn)行了大幅提升之外，測試數據質(zhì)量表現也非常優(yōu)異。PacBio SMRT測序時(shí)錯誤是隨機發(fā)生的，后續的分析可以進(jìn)行自身校正，測序深度的增加會(huì )顯著(zhù)提升reads的準確度。在Sequel II平臺上，達到40X的測序深度，序列的準確度可達99.999%（Q50），另外由于SMRT測序技術(shù)為單分子測序技術(shù)，沒(méi)有PCR擴增偏好性，因此對序列的GC含量沒(méi)有偏好性，在高/低GC含量區域，覆蓋仍舊非常均一。
應用方向
變異檢測
SMRT測序技術(shù)由于其無(wú)PCR擴增偏好性和超長(cháng)讀長(cháng)的技術(shù)特點(diǎn)，非常適合做檢測結構變異檢測，目前升級后的Sequel II平臺采用Hifi 文庫進(jìn)行CCS測序能夠顯著(zhù)提升堿基準確度，做到同時(shí)兼顧長(cháng)讀長(cháng)和高準確度，除做結構變異檢測外，能夠適用于SNP、InDel等其它類(lèi)型的變異檢測。
基因組組裝
PacBio SMRT測序已經(jīng)成為目前基因組組裝中廣泛使用的技術(shù)手段，Sequel II平臺的推出將使得基因組組裝的成本進(jìn)一步下降，結合CLR文庫進(jìn)行大片段測序，未來(lái)SMRT技術(shù)在基因組組裝領(lǐng)域的應該將得到進(jìn)一步的拓展。
全長(cháng)轉錄組
全長(cháng)轉錄組采用Sequel II平臺的Hifi文庫進(jìn)行測序，單張SMRT Cell將產(chǎn)出更多的polymerase reads和更長(cháng)的酶讀長(cháng)，通過(guò)CCS糾錯，能夠幫助研究者獲得更多高質(zhì)量的全長(cháng)轉錄本，助力可變剪切、融合基因等的深入研究。
安諾實(shí)力
安諾優(yōu)達基因科技成立于2012年，總部位于北京，是中國基因組行業(yè)知名企業(yè)，專(zhuān)注于新一代基因組學(xué)技術(shù)在人類(lèi)醫學(xué)健康和生命科學(xué)研究?jì)纱箢I(lǐng)域的產(chǎn)業(yè)化應用。自2017年安諾優(yōu)達推出了三代測序以來(lái)，已經(jīng)搭建了成熟的三代基因組組裝、變異檢測、轉錄組學(xué)、表觀(guān)組學(xué)分析流程，并且積累了豐富的項目經(jīng)驗。尤其是針對于三代測序在醫學(xué)上的應用，推出了基于三代人重測序為核心的多組學(xué)精準解決方案，不僅可以解析全基因組變異信息，進(jìn)行表型相關(guān)性分析、顯性/隱性遺傳模式分析、復合雜合遺傳模式分析以及靶向藥物反應分析等，還可以通過(guò)與Hi-C、RNA-seq等多組學(xué)聯(lián)合解析腫瘤、疾病發(fā)病機制，助力人類(lèi)疾病與健康研究。
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