利用微生物將生物質(zhì)原料轉化為燃料、材料和化學(xué)品是生物制造領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),其關(guān)鍵挑戰是如何實(shí)現生物質(zhì)中葡萄糖等六碳糖和木糖等五碳糖的同等高效利用。
已經(jīng)有很多研究嘗試對單一菌株的代謝途徑進(jìn)行改造,或采用不同的菌株進(jìn)行分工合作,以實(shí)現五、六碳糖的同步利用。但受限于五碳糖不能被高效利用,目標化學(xué)品的生產(chǎn)效率普遍不高。
近年來(lái),隨著(zhù)合成生物學(xué)的快速發(fā)展和微生物組計劃的提出,合成微生物組也在加速發(fā)展。為了實(shí)現生物質(zhì)原料中五、六碳糖組分的同等高效利用,中國科學(xué)院微生物研究所李寅課題組提出了創(chuàng )制“Y型人工菌群”的新概念(如圖)。Y型人工菌群由兩株源于同一出發(fā)菌株、能夠生產(chǎn)同樣目標產(chǎn)物的工程菌株構成。Y型的兩個(gè)“頭部”代表五、六碳糖的代謝途徑,一個(gè)“身體”代表共同的目標產(chǎn)物生產(chǎn)途徑。
Y型人工菌群應當具備四個(gè)特點(diǎn):(1)能同等高效代謝五、六碳糖;(2)五、六碳糖的代謝正交,互不干擾;(3)五、六碳糖的代謝速率與目標產(chǎn)物生產(chǎn)速率匹配;(4)菌群組成菌株均為全染色體編輯,無(wú)需抗生素和誘導劑,以保持生產(chǎn)過(guò)程中的遺傳穩定性。
為測試這一概念可行性,研究人員以丁醇為目標產(chǎn)物,通過(guò)對大腸桿菌進(jìn)行系統的代謝工程改造,創(chuàng )制了一個(gè)Y型人工菌群。其中一株菌為能夠優(yōu)先利用六碳糖高產(chǎn)丁醇的大腸桿菌EB243,另外一株菌為能夠高效利用五碳糖高產(chǎn)丁醇的大腸桿菌EB243X。該菌群以混合糖為原料進(jìn)行批式發(fā)酵,可生產(chǎn)約21 g/L丁醇,得率為理論值的85%,是目前報道利用混合糖生產(chǎn)丁醇的水平。
進(jìn)一步對該Y型人工菌群進(jìn)行分析發(fā)現,可通過(guò)調整兩個(gè)菌株的初始比例,使該菌群適應不同比例的五、六碳糖底物以及不同的通氣條件,故Y型人工菌群表現出較強的適應性和結構穩定性,具有工業(yè)應用的潛力。
這項研究是該課題組繼2017年創(chuàng )建全染色體編輯的高產(chǎn)丁醇菌株(Metabolic Engineering, 2017, 44: 284-292)后又一具有工業(yè)化潛力的研究,為利用合成微生物組思想解決五、六碳糖共利用問(wèn)題提供了新思路,也為進(jìn)一步降低生物法生產(chǎn)丁醇的成本奠定了基礎。
相關(guān)工作已發(fā)表在領(lǐng)域期刊Metabolic Engineering上,博士生趙春華和盧旺達籍博士生Jean Paul Sinumvayo為該文的共同第一作者,研究員李寅和張延平為共同通訊作者。該項研究得到國家自然科學(xué)基金和“863”計劃資助。
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