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Cell重磅:AI從頭設計微型蛋白調控鈉通道,逆轉心律失常和癲癇

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作者:王聰  來(lái)源:生物世界
  2025-08-25
離子通道是細胞膜上的一類(lèi)特殊蛋白質(zhì),負責調控離子的跨膜流動(dòng),在維持細胞電生理活動(dòng)和信號轉導中起關(guān)鍵作用,例如電壓門(mén)控鈉離子通道(NaV),通過(guò)快速介導鈉離子(Na+)內流觸發(fā)電信號傳導,是調控可興奮細胞(例如神經(jīng)元、心肌、骨骼肌細胞)動(dòng)作電位的關(guān)鍵,其功能異常會(huì )導致持續性鈉電流(INaL)增強,這是導致心律失常、癲癇、肌強直、偏頭痛和智力障礙等多種嚴重疾病的共同分子機制。

       離子通道是細胞膜上的一類(lèi)特殊蛋白質(zhì),負責調控離子的跨膜流動(dòng),在維持細胞電生理活動(dòng)和信號轉導中起關(guān)鍵作用,例如電壓門(mén)控鈉離子通道(NaV),通過(guò)快速介導鈉離子(Na+)內流觸發(fā)電信號傳導,是調控可興奮細胞(例如神經(jīng)元、心肌、骨骼肌細胞)動(dòng)作電位的關(guān)鍵,其功能異常會(huì )導致持續性鈉電流(INaL)增強,這是導致心律失常、癲癇、肌強直、偏頭痛和智力障礙等多種嚴重疾病的共同分子機制。

       能夠精準調控離子通道功能的策略備受期待,然而,包括小分子藥物學(xué)在內的現有方法存在局限性,且常常會(huì )產(chǎn)生脫靶效應。在自然界中,離子通道的功能通過(guò)進(jìn)化而來(lái)的調節蛋白進(jìn)行定制,以滿(mǎn)足不同的生理需求。過(guò)去幾十年的結構生物學(xué)研究為離子通道-調控蛋白的相互作用提供了前所未有的原子級視角,并揭示了調控機制。然而,從頭設計或合成具有高度特異性的離子通道調控蛋白,一直未能實(shí)現。

       在自然界中,離子通道的功能可塑性是這些蛋白質(zhì)的一個(gè)顯著(zhù)特征,這通常通過(guò)與多種輔助亞基或調控蛋白的結合來(lái)實(shí)現,這些輔助亞基或調控蛋白經(jīng)過(guò)漫長(cháng)的進(jìn)化以微調特定通道的特性。過(guò)去幾十年的結構生物學(xué)研究為離子通道-調控蛋白的相互作用提供了前所未有的原子級視角,并揭示了調控機制。然而,從頭設計或合成具有高度特異性的離子通道調控蛋白,一直未能實(shí)現。

       2025 年 8 月 18 日,哥倫比亞大學(xué)的研究人員在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Cell 上發(fā)表了題為:De novo design of a peptide modulator to reverse sodium channel dysfunction linked to cardiac arrhythmias and epilepsy 的研究論文。

       該研究首次通過(guò)人工智能(AI)從頭設計出特異性靶向 NaV1.5 的微型調控蛋白--ELIXIR,可精準修復鈉離子通道功能障礙,逆轉相關(guān)心律失常和癲癇。

2025 年 8 月 18 日,哥倫比亞大學(xué)的研究人員在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Cell 上發(fā)表了題為:De novo design of a peptide modulator to reverse sodium channel dysfunction linked to cardiac arrhythmias and epilepsy 的研究論文。

       離子通道的活動(dòng)是動(dòng)態(tài)且受到嚴格調控的,這使得細胞能夠調整自身的電學(xué)特性以適應生命活動(dòng)的復雜需求。對于電壓門(mén)控離子通道而言,其功能的病理生理變化會(huì )導致通道動(dòng)力學(xué)發(fā)生改變,從而擾亂整體的電生理信號傳導。例如電壓門(mén)控鈉離子通道(Na?),是人體電信號的"啟動(dòng)開(kāi)關(guān)",其快速開(kāi)閉特性控制著(zhù)心肌收縮與神經(jīng)元放電。當基因突變(例如SCN5A、SCN8A 基因突變)或病理?yè)p傷(例如心力衰竭、缺血)破壞通道的"自動(dòng)關(guān)閉"機制時(shí),會(huì )導致持續性鈉電流(INaL)異常增大,從而誘發(fā)心律失常,以及神經(jīng)元過(guò)度興奮引發(fā)的癲癇。

       傳統藥物,例如雷諾嗪,能夠抑制心肌細胞的 INaL,用于治療心絞痛和心率異常,但會(huì )誤傷正常鈉電流,且對部分突變通道無(wú)效。

       那么,我們可否利用蛋白質(zhì)從頭設計,針對性設計一種"智能補丁",來(lái)修復發(fā)生故障的離子通道?

       在這項最新研究中,研究團隊基于電壓門(mén)控鈉離子通道(Na?)的蛋白結構,利用蛋白質(zhì)計算設計平臺--AfDesign,模擬了數百萬(wàn)種不同的多肽構型,最終"幻想"出僅由 21 個(gè)氨基酸組成的多肽鏈--ELIXIR(engineered late-current inhibitor X by inactivation-gate release)。

       ELIXIR 能夠競爭性結合到Na?1.5 的羧基末端結構域(CTD),從而釋放被"卡住"的失活門(mén)(IG),促使通道正常關(guān)閉。進(jìn)一步實(shí)驗驗證顯示,ELIXIR 的結合強度達亞微摩爾級,且僅靶向病理狀態(tài)下的 INaL。

       研究團隊進(jìn)一步驗證了 ELIXIR 對心臟和大腦的實(shí)際保護效果,結果顯示,在細胞層面,ELIXIR 使突變通道(ΔKPQ、F1759A等)的 INaL 降低 3-12 倍,在心力衰竭小鼠中,ELIXIR 穩定了心律,并成功逆轉了長(cháng) QT 綜合征的心臟細胞的異常電信號。在癲癇模型神經(jīng)元中,ELIXIR 恢復了動(dòng)作電位時(shí)程,顯著(zhù)降低了癲癇神經(jīng)元的"去極化阻滯",抑制了過(guò)度興奮。

       該研究的亮點(diǎn):

  •        從頭設計的多肽 ELIXIR 可逆轉鈉通道的獲得性功能缺陷;

  •        ELIXIR 表現出選擇性靶向"致病性"的持續性鈉電流;

  •        在癲癇相關(guān) SCN8A 模型的神經(jīng)元中,ELIXIR 減少了去極化阻滯;

  •        ELIXIR 在多種疾病模型中縮短了心臟動(dòng)作電位時(shí)程。

研究團隊進(jìn)一步驗證了 ELIXIR 對心臟和大腦的實(shí)際保護效果

       總的來(lái)說(shuō),這項研究證明了從頭設計蛋白質(zhì)在合成離子通道調控蛋白方面的有效性,首次利用 AI 從頭設計的微型蛋白重置了心臟和大腦的電信號開(kāi)關(guān),這為通過(guò)蛋白質(zhì)從頭設計來(lái)治療離子通道異常引起的心律失常、癲癇、慢性疼痛等多種疾病奠定了基礎。

       論文鏈接:https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)00860-8

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