繼三級公立醫院績(jì)效考核中剔除"納入創(chuàng )新藥應用指導目錄中藥品收入"之后，二級醫院的績(jì)效考核也延續了這一措施。
8月27日，國家衛健委辦公廳印發(fā)《關(guān)于印發(fā)國家二級公立醫院績(jì)效監測操作手冊（2025版）的通知》，該《通知》顯示，在2024版基礎上進(jìn)行修訂完善，形成了《國家二級公立醫院績(jì)效監測操作手冊（2025版）》（以下簡(jiǎn)稱(chēng)《手冊》）。
《手冊》顯示，二級公立醫院績(jì)效監測指標體系共包含指標 28 個(gè)（均為定量指標），其中國家監測指標 21 個(gè)。其中值得一提的是增加了指標監測內容，在指標 20-22 的延伸指標中追加剔除納入創(chuàng )新藥應用指導目錄中藥品收入。
在公立二級醫院監測的28個(gè)指標中，基藥采購金額占比、國采藥品中選藥品金額占比指標導向是逐步提高，而重點(diǎn)監控藥品收入占比（指的是第一批目錄20個(gè)品種）、重點(diǎn)高值耗材收入占比（第一批18個(gè)品種）則是監測比較。
此外，在費用增幅方面，醫療收入增幅指標導向是監測比較，而次均費用增幅、次均藥品費用增幅則是逐步降低。
與公立三級醫院績(jì)效相比，二級醫院的指標相對寬松。
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